「愛宕神社」から少し北へ戻り、右に折れて東へ向うと、芭蕉五庵（無名庵、西麓庵、東麓庵、瓢竹庵など）の１つで、現在も唯１つ残っている県史跡・名勝「蓑虫庵（みのむしあん）」があります。芭蕉の門弟服部土芳（どぼう）が、１６８８年（元禄元年）３月４日入庵して、初めは「些中（さちゅう）庵」と呼んでいたが、その数日後に芭蕉が訪れて、面壁の像を描き、「蓑虫の音を聞きにこよ草の庵」と讃してから蓑虫が些中に同音で相通じるので、以後は「蓑虫庵」と呼ぶ様になって、土芳は、１７３０年（享保１５年）１月１８日７４歳で没するまで、ここに隠棲し、その間伊賀連衆の要で、芭蕉の偉業を後世に伝えました。
芭蕉が最も好んだ庭に「古池や蛙飛び込む水の音」の句碑が建っています。蕉風開眼を表わす円窓を開けて、飛躍する蛙を浮彫りにした名碑で、後ろの池に今は、蛙が１匹もいません。その他、庭内には、藤堂藩士服部家の養子として、生涯を独身で通し、ここで亡くなった土芳の供養墓を昭和１３年１月１９日西蓮寺から移した「服部土芳供養墓所」、芭蕉像を安置し、腋侍に土芳の位牌を祀る「芭蕉堂」、土芳の句「卒度往て若菜摘はや鶴の傍」を刻む「若菜塚」、芭蕉４３才の時の句碑「よく見ればなづな花咲く垣ねかな」の「なづな塚」、そして、神部満之助氏の句碑「みの虫の音を聞ばやとこの庵」の「みの虫塚」があります。
「蓑虫庵」の塀に沿って北へ向かい、更に大通りを渡って北へ行くと、通りに面して右側に、春４月下旬に牡丹が咲く、大峯山当山派「松本院」があります。宗祖は弘法大師空海、派祖が理源大師で、真言宗では通常、本尊は「大日如来」ですが、当院では、「大日如来」の徳を表す「大聖不動尊」を安置しています。毎年１月８日本堂で日に２回、初祈祷が行われ、伊賀市内外から延べ約２００人もの参詣客が集まり、長さ約２３ｍの大きな数珠を輪になって皆が繰りながら、般若心経を唱えて家内安全を祈願し、その後、境内で初護摩供が行われ、護摩木を焚きながら参拝者の名を住職が読み上げて、また、家内安全を祈祷されます。